Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ACTG1P63261 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ACTG1P63261 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms