Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVFRD-1P60508 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms