Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB25P57735 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAB25P57735 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RAB25P57735 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RAB25P57735 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RAB25P57735 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RAB25P57735 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms