Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FNTBP49356 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FNTBP49356 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FNTBP49356 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FNTBP49356 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FNTBP49356 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FNTBP49356 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms