Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MAGEA3P43357 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MAGEA3P43357 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms