Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
MTHFRP42898 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MTHFRP42898 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MTHFRP42898 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms