Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NUP62P37198 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NUP62P37198 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NUP62P37198 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP62P37198 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP62P37198 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NUP62P37198 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NUP62P37198 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms