Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 FCAR-203ENST00000355524 1483 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC021079.1-201ENST00000625268 907 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 IL12A-205ENST00000480787 863 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 AC012653.2-201ENST00000621880 420 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXD11P31277 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC130324.2-201ENST00000580873 638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 RIMKLB-213ENST00000619374 1519 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXD11P31277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms