Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDNFP23560 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDNFP23560 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDNFP23560 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDNFP23560 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDNFP23560 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDNFP23560 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDNFP23560 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDNFP23560 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDNFP23560 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDNFP23560 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDNFP23560 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms