Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT1P21579 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT1P21579 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT1P21579 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT1P21579 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT1P21579 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT1P21579 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT1P21579 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT1P21579 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT1P21579 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT1P21579 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT1P21579 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT1P21579 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms