Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VCLP18206 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCLP18206 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCLP18206 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCLP18206 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCLP18206 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCLP18206 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCLP18206 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCLP18206 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms