Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPCAMP16422 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EPCAMP16422 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms