Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD44P16070 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CD44P16070 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD44P16070 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD44P16070 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD44P16070 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD44P16070 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD44P16070 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD44P16070 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD44P16070 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD44P16070 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD44P16070 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD44P16070 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD44P16070 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms