Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VEGFAP15692 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFAP15692 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms