Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNNT1P13805 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNT1P13805 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms