Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRF1P10914 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IRF1P10914 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IRF1P10914 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms