Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RD3LP0DJH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RD3LP0DJH9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms