Protein–RNA interactions for Protein: P07948

LYN, Tyrosine-protein kinase Lyn, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNP07948 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LYNP07948 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LYNP07948 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LYNP07948 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LYNP07948 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LYNP07948 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
LYNP07948 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYNP07948 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
LYNP07948 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
LYNP07948 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms