Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGHV3-33P01772 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IGHV3-33P01772 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IGHV3-33P01772 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms