Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEC24AO95486 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEC24AO95486 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms