Protein–RNA interactions for Protein: O95347

SMC2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC2O95347 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMC2O95347 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC2O95347 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC2O95347 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC2O95347 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMC2O95347 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMC2O95347 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMC2O95347 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMC2O95347 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMC2O95347 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms