Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TRMUO75648 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
TRMUO75648 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRMUO75648 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRMUO75648 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms