Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PPLO60437 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PPLO60437 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PPLO60437 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PPLO60437 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PPLO60437 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPLO60437 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPLO60437 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPLO60437 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPLO60437 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PPLO60437 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PPLO60437 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PPLO60437 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
PPLO60437 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
PPLO60437 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PPLO60437 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PPLO60437 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PPLO60437 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
PPLO60437 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PPLO60437 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPLO60437 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PPLO60437 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PPLO60437 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms