Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TSPAN6O43657 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TSPAN6O43657 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms