Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■■■ 27.1
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RBFOX2O43251 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 27.1
RBFOX2O43251 GYS1-203ENST00000457974 718 ntTSL 312.44□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 27
RBFOX2O43251 GYS1-202ENST00000323798 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-6■■■■■ 27
RBFOX2O43251 GYS1-201ENST00000263276 3378 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 27
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RBFOX2O43251 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 27
RBFOX2O43251 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 59.44□□□□□ -0.93e-10■■■■■ 27
RBFOX2O43251 CBX4-203ENST00000494546 432 ntTSL 325.47■■□□□ 1.672e-8■■■■■ 27
RBFOX2O43251 SLC13A5-210ENST00000574824 2506 ntTSL 210.98□□□□□ -0.656e-9■■■■■ 27
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RBFOX2O43251 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-11■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 ELMSAN1-205ENST00000435371 3839 ntTSL 1 (best)11.75□□□□□ -0.533e-11■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 ELMSAN1-211ENST00000486739 534 ntTSL 47.53□□□□□ -1.23e-11■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.371e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 CHTF18-208ENST00000471202 4494 ntTSL 212.09□□□□□ -0.471e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.681e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 315.1■□□□□ 0.012e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.253e-14■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.057e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.597e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 TNFRSF1B-203ENST00000492361 3583 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.44e-6■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.54e-6■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.141e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.631e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 CCNDBP1-209ENST00000566833 577 ntTSL 210.73□□□□□ -0.691e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 ZSCAN20-202ENST00000373413 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.751e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 ZSCAN20-203ENST00000480917 877 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 ZSCAN20-201ENST00000361328 4316 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.191e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.531e-7■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.295e-7■■■■■ 26.9
RBFOX2O43251 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.254e-15■■■■■ 26.9
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RBFOX2O43251 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.92□□□□□ -0.184e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 C11orf24-205ENST00000530166 941 ntTSL 313.39□□□□□ -0.274e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.052e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-207ENST00000460425 2764 ntTSL 214.06□□□□□ -0.162e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.066e-9■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ITGB5-209ENST00000488466 971 ntTSL 512.31□□□□□ -0.446e-9■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 ITGB5-204ENST00000465464 1164 ntTSL 59.32□□□□□ -0.926e-9■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 SACM1L-210ENST00000463659 950 ntTSL 36.54□□□□□ -1.363e-13■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.351e-8■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.871e-8■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 EP400-205ENST00000389562 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 LRMDA-201ENST00000372499 899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.33e-6■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 LAMB1-210ENST00000474380 945 ntTSL 57.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 26.8
RBFOX2O43251 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 517.24■□□□□ 0.355e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 KMT5C-202ENST00000402499 888 ntTSL 217.5■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 KMT5C-208ENST00000498738 713 ntTSL 516.64■□□□□ 0.257e-17■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-11■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-213ENST00000456693 750 ntTSL 515.34■□□□□ 0.051e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 KMT5C-210ENST00000589338 1601 ntTSL 1 (best)15.14■□□□□ 0.011e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-210ENST00000448708 549 ntTSL 514.42□□□□□ -0.11e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 KMT5C-205ENST00000464185 2235 ntTSL 1 (best)14.31□□□□□ -0.121e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.131e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-224ENST00000496396 944 ntTSL 1 (best)14.13□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 COBLL1-209ENST00000445474 575 ntTSL 414.08□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 26.7
RBFOX2O43251 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 313.94□□□□□ -0.181e-7■■■■□ 26.7
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