Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ARPC1BO15143 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ARPC1BO15143 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms