Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SEMA3EO15041 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SEMA3EO15041 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms