Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PIK3C2AO00443 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIK3C2AO00443 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms