Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TULP1O00294 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TULP1O00294 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TULP1O00294 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TULP1O00294 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TULP1O00294 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms