Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBXN8O00124 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
UBXN8O00124 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms