Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
J3QR89 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
J3QR89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
J3QR89 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
J3QR89 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
J3QR89 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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J3QR89 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
J3QR89 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
J3QR89 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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