Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TMCO5BA8MYB1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMCO5BA8MYB1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms