Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37CA5D8V6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VPS37CA5D8V6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms