Protein–RNA interactions for Protein: A2RU37

C9orf170, Uncharacterized protein C9orf170, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170A2RU37 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
C9orf170A2RU37 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
C9orf170A2RU37 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms