Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCDHB2Q9Y5E7 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PCDHB2Q9Y5E7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms