Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HES2Q9Y543 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HES2Q9Y543 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms