Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYNRGQ9UMZ2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms