Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RCAN3Q9UKA8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RCAN3Q9UKA8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms