Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCTN4Q9UJW0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCTN4Q9UJW0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms