Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
MBD2Q9UBB5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MBD2Q9UBB5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms