Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RDH8Q9NYR8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RDH8Q9NYR8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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