Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP39A1Q9NYL5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CYP39A1Q9NYL5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms