Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRMT1Q9NXH9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRMT1Q9NXH9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms