Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
AP5S1Q9NUS5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
AP5S1Q9NUS5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms