Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ2

PRDM16, PR domain zinc finger protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM16Q9HAZ2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM16Q9HAZ2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRDM16Q9HAZ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms