Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD4Q9H223 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD4Q9H223 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms