Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTR3CQ9C0K3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACTR3CQ9C0K3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms