Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC46A2Q9BY10 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC46A2Q9BY10 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms