Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
BRIP1Q9BX63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BRIP1Q9BX63 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
BRIP1Q9BX63 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms