Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRBNQ96SW2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRBNQ96SW2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRBNQ96SW2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms